104303 Molekularbiologische Grundübung

Wintersemester 2016/2017 | Stand: 18.09.2017 LV auf Merkliste setzen
104303
Molekularbiologische Grundübung
VU 5
7,5
Block
jährlich
Deutsch

Die Studierenden erwerben Kenntnisse über:

  • Wissenschaftliche Datenbanken & Bioinformatische Auswertung von DNA/mRNA Information
  •  Primerdesign & in silico Klonierung
  • Extraktion & Reinigung von DNA/RNA
  • Synthese von cDNA
  • Polymerase-Kettenreaktion (PCR)
  • Klonierung von PCR-Fragmenten
  • Transformation von DNA in E. coli
  • Verifizierung der klonierten DNA Konstrukte („Blue-White-Screening“, colony PCR, Restriktionsanalyse, Agarose-Gelelektrophorese)
  • Erstellung von Plasmid-Karten
  • Klonierung von DNA-Konstrukten zur Expression von Fusions-Proteinen

 Zusätzlich werden einige Grundlagen der Bioinformatik behandelt:

  • Nutzung bioinformatischer Datenbanken (NCBI, Pubmed, Ensembl, ZFIN)
  • Alignments/Suche von Sequenzen (lalign, blast)
  • in silico Klonierungen (pDraw, Benchling)
  • Primerdesign
  • Nukleinsäuren
  • Zellaufschluss
  • DNA/RNA Extraktion, Fällung und Reinigung
  • Gelelektrophorese
  • Restriktionsenzyme
  • Polymerase-Kettenreaktion (PCR)
  • Klonierung (Restriktionsverdau, Ligation, Transformation)
  • Bioinformatische Datenbanken & in silico Klonierung
  • Kursplan:
    • 1. Woche: Klonierung von zwei Genen aus dem Zebrafisch (gDNA/cDNA), ganzer Kurs gemeinsam
    • 2. Woche: individuelle Klonierungs-Projekte in Kleingruppen

  • RNA/DNA Extraktion und Aufreinigung
  • cDNA Synthese mittels reverser Transkription
  • in silico PCR/Klonierung
  • PCR basierte Amplifikationen von cDNA/gDNA Abschnitten
  • TA-Klonierung
  • Verifizierung der Klonierung über „blue-white-screening“, colony PCR und Restriktionsanalyse
  • Eingangsklausur nach der Vorlesung, deren positive Beurteilung die Voraussetzung zur Teilnahme an den praktischen Übungen ist!
  • Kombinierte Leistungsbeurteilung durch aktive Teilnahme an der Übung sowie Abschlussprotokoll.

  • Alberts et al., „Lehrbuch der Molekularen Zellbiologie“ (4. Auflage), 936 Seiten, ISBN-13:978-3527328246
  • Lottspeich & Engels, „Bioanalytik“ (3. Auflage), 1208 Seiten, ISBN-13:978-3827429421
  • T.A. Brown, „Genomes 3“ (3. Auflage), 750 Seiten, ISBN-13: 978-0815341383

Positiv beurteilte Pflichtmodule 2, 4, 14 und 15

Vorbesprechung am Montag, 3.10. um 17.30 h in Hörsaal C / Technik.

Bitte ausschließlich in Gruppe 0 (= Vorlesung) anmelden.

Eine (vorläufige) Kurseinteilung erfolgt entsprechend der Wünsche im Rahmen der Vorbesprechung. Nach Auswertung der Eingangsprüfung erfolgt die Kurszuteilung gemäß den Präferenzen und gereiht entsprechend des geltenden Curriculums (§ 4):

 

1.            Anwesenheit bei der Vorbesprechung (persönlich oder durch Stellvertreterin oder Stellvertreter).

2.            Datum der Erfüllung der Anmeldungsvoraussetzung/en, wobei jene Studierenden vorgezogen werden, die die Anmeldungsvoraussetzung/en früher erfüllt haben.

3.            Anzahl der Semester, die die Studierenden für das Bachelorstudium Biologie gemeldet sind, wobei jene Studierenden vorgezogen werden, die länger gemeldet sind.

4.            Losentscheid.

 

03.10.2016
Gruppe 0
Wilfinger A.
Datum Uhrzeit Ort
Mo 03.10.2016
17.30 - 19.00 HS C (Technik) HS C (Technik) Barrierefrei
Di 04.10.2016
17.30 - 19.00 HS D (Technik) HS D (Technik) Barrierefrei
Mi 05.10.2016
17.30 - 19.00 HS D (Technik) HS D (Technik) Barrierefrei
Fr 07.10.2016
12.00 - 14.00 HS F (Technik) HS F (Technik) Barrierefrei Prüfung
Gruppe 1
Aanstad P.
Datum Uhrzeit Ort
Mo 10.10.2016
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Di 11.10.2016
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Mi 12.10.2016
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Do 13.10.2016
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Fr 14.10.2016
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Mo 17.10.2016
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Di 18.10.2016
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Mi 19.10.2016
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Do 20.10.2016
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Fr 21.10.2016
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Gruppe 2
Lorincz R., Salti A.
Datum Uhrzeit Ort
Mo 07.11.2016
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Di 08.11.2016
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Mi 09.11.2016
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Do 10.11.2016
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Fr 11.11.2016
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Mo 14.11.2016
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Di 15.11.2016
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Mi 16.11.2016
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Do 17.11.2016
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Fr 18.11.2016
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Gruppe 3
Fischer P.
Datum Uhrzeit Ort
Mo 05.12.2016
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Di 06.12.2016
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Mi 07.12.2016
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Fr 09.12.2016
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Mo 12.12.2016
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Di 13.12.2016
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Mi 14.12.2016
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Do 15.12.2016
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Fr 16.12.2016
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Gruppe 4
Wilfinger A.
Datum Uhrzeit Ort
Mo 09.01.2017
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Di 10.01.2017
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Mi 11.01.2017
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Do 12.01.2017
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Fr 13.01.2017
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Mo 16.01.2017
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Di 17.01.2017
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Mi 18.01.2017
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Do 19.01.2017
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Fr 20.01.2017
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei