104702 UE Spezielle Molekularbiologie

Wintersemester 2023/2024 | Stand: 19.09.2023 LV auf Merkliste setzen
104702
UE Spezielle Molekularbiologie
UE 4
6
Block
jährlich
Deutsch

Die Studierenden erwerben Kenntnisse über:

  • Wissenschaftliche Datenbanken & Bioinformatische Auswertung von DNA/mRNA Information
  •  Primerdesign & in silico Klonierung
  • Extraktion & Reinigung von DNA/RNA
  • Synthese von cDNA
  • Polymerase-Kettenreaktion (PCR)
  • Klonierung von PCR-Fragmenten
  • Transformation von DNA in E. coli
  • Verifizierung der klonierten DNA Konstrukte („Blue-White-Screening“, colony PCR, Restriktionsanalyse, Agarose-Gelelektrophorese)
  • Erstellung von Plasmid-Karten
  • Klonierung von DNA-Konstrukten zur Expression von Fusions-Proteinen

 Zusätzlich werden einige Grundlagen der Bioinformatik behandelt:

  • Nutzung bioinformatischer Datenbanken (NCBI, Pubmed, Ensembl, ZFIN)
  • Alignments/Suche von Sequenzen (lalign, blast)
  • in silico Klonierungen (pDraw, Benchling)
  • Primerdesign
  • Nukleinsäuren
  • Zellaufschluss
  • DNA/RNA Extraktion, Fällung und Reinigung
  • Gelelektrophorese
  • Restriktionsenzyme
  • Polymerase-Kettenreaktion (PCR)
  • Klonierung (Restriktionsverdau, Ligation, Transformation)
  • Bioinformatische Datenbanken & in silico Klonierung
  • Kursplan:
    • 1. Woche: Klonierung von zwei Genen aus dem Zebrafisch (gDNA/cDNA), ganzer Kurs gemeinsam
    • 2. Woche: individuelle Klonierungs-Projekte in Kleingruppen

  • RNA/DNA Extraktion und Aufreinigung
  • cDNA Synthese mittels reverser Transkription
  • in silico PCR/Klonierung
  • PCR basierte Amplifikationen von cDNA/gDNA Abschnitten
  • TA-Klonierung
  • Verifizierung der Klonierung über „blue-white-screening“, colony PCR und Restriktionsanalyse
  • Eingangsklausur nach der Vorlesung, deren positive Beurteilung die Voraussetzung zur Teilnahme an den praktischen Übungen ist!
  • Kombinierte Leistungsbeurteilung durch aktive Teilnahme an der Übung sowie Abschlussprotokoll.

  • Alberts et al., „Lehrbuch der Molekularen Zellbiologie“ (4. Auflage), 936 Seiten, ISBN-13:978-3527328246
  • Lottspeich & Engels, „Bioanalytik“ (3. Auflage), 1208 Seiten, ISBN-13:978-3827429421
  • T.A. Brown, „Genomes 3“ (3. Auflage), 750 Seiten, ISBN-13: 978-0815341383
  • Praktikumsanleitung (wird auf OLAT zu finden sein)

Positiv beurteilte Pflichtmodule 2, 3, 11

Bitte ausschließlich in Gruppe 0 (= Vorlesung) anmelden.

Eine (vorläufige) Kurseinteilung erfolgt entsprechend der Wünsche im Rahmen der Vorbesprechung am 2.10. in HS B. Nach Auswertung der Eingangsprüfung erfolgt die Kurszuteilung gemäß den Präferenzen und gereiht entsprechend des geltenden Curriculums (§ 4):

 

1.            Anwesenheit bei der Vorbesprechung (persönlich oder durch Stellvertreterin oder Stellvertreter).

2.            Datum der Erfüllung der Anmeldungsvoraussetzung/en, wobei jene Studierenden vorgezogen werden, die die Anmeldungsvoraussetzung/en früher erfüllt haben.

3.            Anzahl der Semester, die die Studierenden für das Bachelorstudium Biologie gemeldet sind, wobei jene Studierenden vorgezogen werden, die länger gemeldet sind.

4.            Losentscheid.

 

wird bekannt gegeben
Gruppe 1
Dittrich R., Regele D., Sathianathan M., Stefan E.
Datum Uhrzeit Ort
Mo 09.10.2023
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Di 10.10.2023
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Mi 11.10.2023
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Do 12.10.2023
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Mo 16.10.2023
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Di 17.10.2023
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Mi 18.10.2023
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Do 19.10.2023
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Fr 20.10.2023
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Gruppe 2
Dittrich R., Regele D., Sathianathan M., Stefan E.
Datum Uhrzeit Ort
Mo 04.12.2023
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Di 05.12.2023
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Mi 06.12.2023
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Do 07.12.2023
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Mo 11.12.2023
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Di 12.12.2023
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Mi 13.12.2023
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Do 14.12.2023
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei
Fr 15.12.2023
09.00 - 17.00 PR Biologie West 0/403a PR Biologie West 0/403a Barrierefrei