LFU:online

Die Studierenden lernen ausgewählte bioinformatische und statistische Methoden zur Untersuchung von Mikrobiomen kennen.

Basierend auf Testdatensätzen werden gängige bioinformatische Analyseprotokolle/Programme vergleichend angewandt. Die Ergebnisse werden visualisiert und mittels geeigneter statistischer Methoden eingehend analysiert. Abschließend erfolgt eine Interpretation aus ökologischer Sicht. Die erlernten Fähigkeiten werden anhand eines individuellen Datensatzes vertieft.

Praktische Übung am Computer:

I. Bioinformatische Datenanalyse: Illumina MiSeq Sequenzierdaten werden mittels CoMA analysiert.

II. Datenvisualisierung.

III. Statistische Datenanalyse.

IV. Analyse und Interpretation eines individuellen Datensatzes und abschließende Präsentation der Ergebnisse.

Die Gesamtnote errechnet sich aus:

1. Einem Protokoll

2. Mitarbeit

3. Kleinen praktischen Arbeiten

Material zu den Übungen wird rechtzeitig in OLAT bereitgestellt.

Zu dieser Übung gehört das Seminar "Techniques in Microbial Ecology (LV-718766)", in dem wichtige methodische Aspekte diskutiert werden.

Online-Registrierung und Anwesenheit bei der Übungsvorbesprechung sind verpflichtend um die Teilnahme zu bestätigen!

Vorbesprechung und Gruppeneinteilung zu den Übungen: 07.03.22 von 10:30 -11:00 Uhr, HS B