724660 Computersimulationen ident. m. Simulationsmethoden
Sommersemester 2010 | Stand: 05.08.2010 | LV auf Merkliste setzen724660
Computersimulationen ident. m. Simulationsmethoden
VO 2
wöch.
jährlich
Deutsch
In der Vorlesung werden Methoden zur Beschreibung von Molekülen vor allem in der flüssigen Phase – beispielsweise durch Beobachtung der zeitlichen Entwicklung von Systemen – diskutiert. Anwendungen zur Berechnung thermodynamischer Zustandsgrößen, zur Vorhersage struktureller und dynamischer Eigenschaften von Lösungen und zur Konformationsvorhersage von Biomolekülen – beispielsweise in Kombination mit NMR Daten – werden besprochen.
Grundkonzepte
· Wahrscheinlichkeiten
· Ergoden Hypothese
· Molecular Dynamics und Monte-Carlo
· Fundamentale Eigenschaften
Allgemeine Vorgangsweise
· Grundvoraussetzungen
· Randbedingungen
· Equilibrierung
· Cutoff für Potentiale
· Elektrostatische Wechselwirkungen
Molecular Dynamics
· Euler Verfahren
· Integrationsverfahren höherer Ordnung
· Größe des Zeitschritts
· Constrained Dynamics
· Zeitabhängige Eigenschaften
· Kanonisches und NPT Ensemble
· Restrained Dynamics (NMR)
· Berechnung der freien Energie
Monte-Carlo Integrationen
· Separation des Phasenraums
· Integration im Konfigurationsraum
· Der Metropolis-Algorithmus
· Die Bewegung von Molekülen
8. Semester
Beginn: 05.03.2008
Beginn: 05.03.2008
Di 15.30 - 17.00h, SR215
- Fakultät für Chemie und Pharmazie