910699 VU Molecular Analysis of Environmental Samples

Sommersemester 2024 | Stand: 05.08.2024 LV auf Merkliste setzen
910699
VU Molecular Analysis of Environmental Samples
VU 5
7,5
Block
jährlich
Englisch

Die Studierenden sind in der Lage, Forschungsfragen im Bereich molekulare Analyse trophischer Interaktionen und eDNA-basiertes Biomonitoring zu formulieren und der Fragestellung entsprechende Forschungsdesigns zu entwickeln.
Die Studierenden sind in der Lage, die gängigen Laborarbeitsschritte für die Analyse kleinster Mengen von DNA in Umweltproben in einer Reinraumlaborumgebung durchzuführen.
Die Studierenden beherrschen die Grundlagen gängiger Techniken zur bioinformatischen Analyse von Metabarcoding- und qPCR-Daten, sowie deren statistische Auswertung.

Im Rahmen des Kurses wird der wissenschaftliche Ablauf von der Konzeptualisierung von Forschungsfragen und Versuchen, über die Probenahme, die Laboranalyse der gewonnenen Proben mittels diagnostischer und DNA-sequenzbasierter Techniken, die bioinformatische Analyse der gewonnenen Rohdaten, deren statistische Auswertung bis zur Interpretation der gewonnenen Ergebnisse behandelt
Dies inkludiert den Umgang mit programmierbaren Statistikprogrammen, die Einarbeitung in relevante Publikationen, sowie die Gewinnung von Umweltproben und deren Bearbeitung im Reinraumlabor (Lysis, DNA-Extraktion, DNA-Amplifikation, Vorarbeit zur Hochdurchsatzsequenzierung). Der zweite Kursteil fokussiert auf die bioinformatische und statistische Analyse sowie die Interpretation der generierten Daten. Die Teilnehmenden haben zusätzlich die Möglichkeit, persönliche Forschungsprojekte im Rahmen des Kurses vorzustellen.

siehe Termine