718767 UE Struktur und Funktion von Mikrobiomen

Sommersemester 2019 | Stand: 22.10.2021 LV auf Merkliste setzen
718767
UE Struktur und Funktion von Mikrobiomen
UE 4
6
Block
2-Jahresrhythmus
Deutsch

Die Studierenden lernen ausgewählte Methoden zur Untersuchung von Mikrobiomen kennen.

Verschiedene Standorte (Grasland, Waldboden, Sumpf) werden in Hinblick auf Zusammensetzung und Aktivität der mikrobiellen Gemeinschaften untersucht (qPCR, NGS-Datenanalyse). Zusätzlich werden physikalisch-chemische und biologische Bodenparameter erfasst und in Verbindung mit den Sequenzdaten statistisch ausgewertet.

Praktische Übung im Labor und am Computer

Labor: DNA-Extraktion, DNA-Quantifizierung, qPCR, Bodenchemie

Computer: NGS Datenanalyse (Illumina MiSeq Datensatz) mit der CoMA Pipeline, Einführung in Statistiksoftware R; statistische Datenauswertung und Visualisierung

Immanenter Prüfungscharakter und Abschlussprojekt. Genauere Informationen folgen.

Material zu den Übungen wird rechtzeitig in OLAT bereitgestellt.

Der Kurs wird in virtuellem Modus abgehalten werden. Daher werden die jeweiligen Termine nicht geblockt stattfinden. Nach Absprache mit den Studierenden werden wir konkrete Termine ausmachen. Wir danken für Ihr Verständnis.

Im Seminar "Techniques in Microbial Ecology (LV-718766)" werden wichtige methodische Aspekte diskutiert; einne Teilnahme an diesem wird daher dringend empfohlen.

Die Anmeldungen erfolgen alle in Gruppe 0.

Online-Registrierung und Anwesenheit bei der Übungsvorbesprechung (auch in Vertretung) ist erforderlich.

Vorbesprechung am 04.03.2019 um 09:00 Uhr, HS E (Technik)

https://www.uibk.ac.at/microbiology/study-affairs/

04.03.2019
Gruppe 0
Hupfauf S., Probst M.
Datum Uhrzeit Ort
Mo 04.03.2019
13.15 - 17.00 rr 19 rr 19 Barrierefrei
Do 23.05.2019
09.00 - 17.00 rr 19 rr 19 Barrierefrei VO-Teil für beide Gruppen
Fr 24.05.2019
09.00 - 17.00 rr 19 rr 19 Barrierefrei VO-Teil für beide Gruppen
Sa 25.05.2019
09.00 - 17.00 HSB 5 HSB 5 Barrierefrei VO-Teil für beide Gruppen
Mo 24.06.2019
17.00 - 20.00 SR 0/501 SR 0/501 Barrierefrei Nachbesprechung Praktikum
Gruppe 1
Hupfauf S., Probst M.
Datum Uhrzeit Ort
Mo 13.05.2019
09.00 - 17.00 Mikrobiol. - Praktikumsraum 2-15 Mikrobiol. - Praktikumsraum 2-15 Barrierefrei Übungsteil
Di 14.05.2019
09.00 - 17.00 Mikrobiol. - Praktikumsraum 2-15 Mikrobiol. - Praktikumsraum 2-15 Barrierefrei Übungsteil
Mi 15.05.2019
09.00 - 17.00 Mikrobiol. - Praktikumsraum 2-15 Mikrobiol. - Praktikumsraum 2-15 Barrierefrei Übungsteil
Gruppe 2
Hupfauf S., Probst M.
Datum Uhrzeit Ort
Mo 13.05.2019
09.00 - 17.00 Mikrobiol. - Praktikumsraum 2-15 Mikrobiol. - Praktikumsraum 2-15 Barrierefrei Übungsteil
Di 14.05.2019
09.00 - 17.00 Mikrobiol. - Praktikumsraum 2-15 Mikrobiol. - Praktikumsraum 2-15 Barrierefrei Übungsteil
Mi 15.05.2019
09.00 - 17.00 Mikrobiol. - Praktikumsraum 2-15 Mikrobiol. - Praktikumsraum 2-15 Barrierefrei Übungsteil