104303 VU Molekularbiologie Grundübung

Wintersemester 2019/2020 | Stand: 28.10.2019 LV auf Merkliste setzen
104303
VU Molekularbiologie Grundübung
VU 5
7,5
Block
jährlich
Deutsch

Die Studierenden erwerben Kenntnisse über:

  • Wissenschaftliche Datenbanken & Bioinformatische Auswertung von DNA/mRNA Information
  •  Primerdesign & in silico Klonierung
  • Extraktion & Reinigung von DNA/RNA
  • Synthese von cDNA
  • Polymerase-Kettenreaktion (PCR)
  • Klonierung von PCR-Fragmenten
  • Transformation von DNA in E. coli
  • Verifizierung der klonierten DNA Konstrukte („Blue-White-Screening“, colony PCR, Restriktionsanalyse, Agarose-Gelelektrophorese)
  • Erstellung von Plasmid-Karten
  • Klonierung von DNA-Konstrukten zur Expression von Fusions-Proteinen

 Zusätzlich werden einige Grundlagen der Bioinformatik behandelt:

  • Nutzung bioinformatischer Datenbanken (NCBI, Pubmed, Ensembl, ZFIN)
  • Alignments/Suche von Sequenzen (lalign, blast)
  • in silico Klonierungen (pDraw, Benchling)
  • Primerdesign
  • Nukleinsäuren
  • Zellaufschluss
  • DNA/RNA Extraktion, Fällung und Reinigung
  • Gelelektrophorese
  • Restriktionsenzyme
  • Polymerase-Kettenreaktion (PCR)
  • Klonierung (Restriktionsverdau, Ligation, Transformation)
  • Bioinformatische Datenbanken & in silico Klonierung
  • Kursplan:
    • 1. Woche: Klonierung von zwei Genen aus dem Zebrafisch (gDNA/cDNA), ganzer Kurs gemeinsam
    • 2. Woche: individuelle Klonierungs-Projekte in Kleingruppen

  • RNA/DNA Extraktion und Aufreinigung
  • cDNA Synthese mittels reverser Transkription
  • in silico PCR/Klonierung
  • PCR basierte Amplifikationen von cDNA/gDNA Abschnitten
  • TA-Klonierung
  • Verifizierung der Klonierung über „blue-white-screening“, colony PCR und Restriktionsanalyse
  • Eingangsklausur nach der Vorlesung, deren positive Beurteilung die Voraussetzung zur Teilnahme an den praktischen Übungen ist!
  • Kombinierte Leistungsbeurteilung durch aktive Teilnahme an der Übung sowie Abschlussprotokoll.

  • Alberts et al., „Lehrbuch der Molekularen Zellbiologie“ (4. Auflage), 936 Seiten, ISBN-13:978-3527328246
  • Lottspeich & Engels, „Bioanalytik“ (3. Auflage), 1208 Seiten, ISBN-13:978-3827429421
  • T.A. Brown, „Genomes 3“ (3. Auflage), 750 Seiten, ISBN-13: 978-0815341383

Positiv beurteilte Pflichtmodule 2, 4, 14 und 15

Vorbesprechung am 1. Oktober 2019 um 10h in HS G  

Bitte ausschließlich in Gruppe 0 (= Vorlesung) anmelden.

Eine (vorläufige) Kurseinteilung erfolgt entsprechend der Wünsche im Rahmen der Vorbesprechung. Nach Auswertung der Eingangsprüfung erfolgt die Kurszuteilung gemäß den Präferenzen und gereiht entsprechend des geltenden Curriculums (§ 4):

 

1.            Anwesenheit bei der Vorbesprechung (persönlich oder durch Stellvertreterin oder Stellvertreter).

2.            Datum der Erfüllung der Anmeldungsvoraussetzung/en, wobei jene Studierenden vorgezogen werden, die die Anmeldungsvoraussetzung/en früher erfüllt haben.

3.            Anzahl der Semester, die die Studierenden für das Bachelorstudium Biologie gemeldet sind, wobei jene Studierenden vorgezogen werden, die länger gemeldet sind.

4.            Losentscheid.

 

wird bekannt gegeben
siehe 104701 und 104702, VO Spezielle Molekularbiologie und UE Spezielle Molekularbiologie